武汉市工程科学技术研究院是武汉市人民政府直属的综合性科研机构，前身是1974年成立的武汉市自动化研究所。1981年4月，组建“武汉市工程科学技术研究中心”，下设“五所一厂”（自动化所、光学所、电汽结构所、计算机所、能源所、试验工厂）。1988年1月，更名为武汉市工程科学技术研究院。2000年12月，整体归口东湖高新区管理。2000至2006年，完成“五所一厂”改制改革。建院以来，共承担科研课题600余项，取得科技成果400余项，获省、市科技进步奖70余项。重点成果有：应用于水下潜艇和同步卫星发射的程序控制器、微机数控冲床等10余项。目前，全院拥有国家卫星定位工程技术中心、工科院科技园孵化器、工科院科创空间3个国家级平台，拥有各类全资及参控股企业20家。

近年来，市工科院以技术创新为“主体”，围绕数字经济、人工智能、大健康等重点产业布局学科力量。在生命大健康领域，以生物细胞产业基地建设为抓手，全链条布局细胞制备、 存储、外泌体应用等关键节点；在信息技术领域，承担科技部863专项“网络漏洞挖掘与利用技术研究”、发改委专项“云业务安全评测专业化服务”等50余项重大课题；发挥电子政务保障职能，累计承担“十八大信息安全测评”、“第七届世界军人运动会”、“东盟博览会”及省市各类政务保障项目400余项；加入了全国科学院联盟，与全国18家地方科研院所建立了战略合作伙伴关系。

市工科院以企业孵化和成果转化为“两翼”，打造了“工科院科技园”国家级科技企业孵化器，坐拥“数字经济”、“大健康”两个孵化园区，累积培育企业400余家、高新技术企业80家、规上企业6家、新三板挂牌企业1家、省级专精特新企业6家、新物种瞪羚企业4家。自2010年创办以来，园区企业累计授权知识产权1808件。2025年园区企业总产值约5.5亿元。工科院科技园孵化器连续五年在国家级科技企业孵化器考核中获得A类（优秀），全院3家孵化载体在全省孵化载体考核中名列前茅，获各类荣誉授牌50余项。2026年3月，入选工信部首批标准级科技型企业孵化器。

下一步，市工科院将围绕建设区域有影响力的产业发展创新研究中心，着力打造“产业发展诊断中心”、“产业技术创新中心”、“科技成果转化中心”、“科技企业育成中心”四个功能中心，立志为武汉高水平建设“国家科技创新中心”提供坚实支撑、做出新的贡献。